Η Συλλογή βρίσκεται στον αρχαιολογικό χώρο των Υρίων στη θέση Λιβάδι, κοντά στη Χώρα της Νάξου.
Το επιτόπιο μουσείο δημιουργήθηκε για να στεγάσει τα ευρήματα από το ιερό του Διονύσου, ένα χώρο
ιδιαίτερης αρχαιολογικής και ιστορικής σημασίας, αφού θεωρείται λίκνο του ιωνικού ρυθμού.
Η λατρευτική δραστηριότητα στο χώρο πιστοποιείται ήδη από τη μυκηναϊκή εποχή, το 14ο αι. π.Χ. και
συνεχίζεται αδιάλειπτα έως τους ύστερους ρωμαϊκούς χρόνους. Σημείο αναφοράς στην ιστορική εξέλιξη
του χώρου αποτελούν, ωστόσο, η γεωμετρική και η αρχαϊκή περίοδος, καθώς το ιερό των Υρίων αποτελεί
ένα από τα πρωιμότερα παραδείγματα μνημειακής αρχιτεκτονικής διαμόρφωσης υπαίθριων λατρευτικών
χώρων ήδη από τις αρχές του 8ου αι. π.Χ., ενώ ο σωζόμενος σήμερα ναός του Διονύσου (575-550 π.Χ.)
είναι ο αρχαιότερος λίθινος ναός ιωνικού ρυθμού στον ελλαδικό χώρο.
Στην έκθεση που λειτουργεί στον αρχαιολογικό χώρο, δίνεται η ευκαιρία στους επισκέπτες να γνωρίσουν
τα ευρήματα του σπουδαίου αυτού ιερού. Πρόκειται κυρίως για αρχιτεκτονικά μέλη και ευρήματα που
σχετίζονται με τις λατρευτικές πρακτικές και αντιλήψεις, όπως αναθήματα πιστών.