Σκοπός του μουσείου είναι η διατήρηση της φαρμακευτικής ιστορίας και τέχνης του νησιού, αλλά και υλικού απ’ όλη την Ελλάδα και το εξωτερικό. Το μουσείο συλλέγει αντικείμενα σχετικά με την φαρμακευτική ιστορία, όπως βιβλία, φωτογραφικό και διαφημιστικό υλικό, εξοπλισμούς κτλ.
Οι δραστηριότητες του μουσείου περιλαμβάνουν εκπαιδευτικά προγράμματα για μαθητές καθώς και την έκδοση του περιοδικού "Ευδήμου Τέχνη", από το 2012. Παράλληλα ετοιμάζεται έκθεση για τα φυρά των Ομηρικών χρόνων και τη χρήση τους.
