H μικρή αρχαιολογική συλλογή Θηβών στις αρχές του 20ου αιώνα εμπλουτίστηκε σε τέτοιο βαθμό από τις ανασκαφές στην Βοιωτία, ώστε έγινε επιτακτική η ανάγκη ανεγέρσεως νέου κτιρίου, το οποίο εγκαινιάστηκε το 1962.
Ο αυξανόμενος πλούτος των αρχαιολογικών ευρημάτων στο νομό Βοιωτίας, επέβαλλε και τη νέα επέκταση του μουσείου, στα πλαίσια της οποίας αναδιοργανώνεται και η έκθεση των συλλογών του. Μέχρι την ολοκλήρωση του έργου, το μουσείο θα παραμείνει κλειστό για το κοινό.
Στις συλλογές του Μουσείου περιλαμβάνονται:
Προϊστορική συλλογή
Μυκηναϊκή συλλογή
Τανάγρας
Συλλογή γλυπτών
Αυλίδας
-
Θεσπιών
Συλλογή αγγείων από το νεκροταφείο
Μυκαλησσού
(Ριτσώνας)
Συλλογή αγγείων και χάλκινων από διάφορες θέσεις
Τα σημαντικότερα εκθέματα του Μουσείου είναι:
Μοναδικός θησαυρός από 42 σφραγιδοκύλινδρους με γλυπτές παραστάσεις που προέρχονται από τη Μεσοποταμία. Βρέθηκαν στο λεγόμενο "Νέο Καδμείο" της Θήβας. Εκτίθενται 28 από αυτούς. Μυκηναϊκής περιόδου, 13ος αιώνας π.Χ.
Πυξίδα (κοσμηματοθήκη) από ελεφαντόδοντο. Από τάφο της Θήβας. Μυκηναϊκής περιόδου, 13ος αιώνας π.Χ.
Σύνολο από 16 πήλινες λάρνακες διακοσμημένες με εικονιστικές παραστάσεις από το μυκηναϊκό νεκροταφείο της Τανάγρας, 13ος αιώνας π.Χ.
Κούροι από το
ιερό του Απόλλωνα στο Πτώο. 6ος αι. π.Χ.
Σύνολο από πέντε επιτύμβιες στήλες από μελανό λίθο με εγχάρακτες παραστάσεις πολεμιστών. Πιθανώς ανήκουν σε πεσόντες στη μάχη του Δηλίου (424 π.Χ.).
Άγαλμα Αρτέμιδος, ρωμαϊκό αντίγραφο από πρωτότυπο των κλασικών χρόνων από το
ναό της Αυλιδείας Αρτέμιδος.
Σύνολο από επτά πήλινες φυλλόσχημες πινακίδες ενεπίγραφες στην Γραμμική Β΄ Γραφή από την "Οπλοθήκη" στη Θήβα. Μυκηναϊκής περιόδου, 13ος αιώνας π.Χ.
Επιτύμβια στήλη από το Ακραίφνιο με ανάγλυφη παράσταση νέου, επίγραμμα και την υπογραφή του γλύπτη. 6ος αι. π.Χ.
Σύνολο χάλκινων ειδωλίων και άλλων αντικειμένων (κάτοπτρο, στλεγγίδες) από την Πυρά Ηρακλέους στο όρος Οίτη.
Άγαλμα της Εκάτης, ελληνιστικών χρόνων από το ναό της Αυλιδείας Αρτέμιδος.